大規(guī)模生物數(shù)據(jù)中的生物信息挖掘技術(shù)研究.pdf

1、在生物信息學領(lǐng)域,挖掘和人類疾病相關(guān)的基因是一個非常重要的研究課題。它對于理解疾病的機制和發(fā)現(xiàn)新的藥物靶標而言都是非常重要的一步。傳統(tǒng)的探測疾病基因的方法有兩種:候選基因法和定位克隆法。在傳統(tǒng)的方法中,研究者們需要分析大量的候選基因。這將浪費很多的人力和時間。因此,人們需要疾病基因探測算法來幫助研究者們縮小搜索范圍,從而加快疾病基因的識別過程。近年來,大規(guī)模實驗技術(shù)如DNA微陣列技術(shù),酵母菌雙雜交系統(tǒng)等產(chǎn)生了海量的大規(guī)模生物數(shù)據(jù)。這些數(shù)

2、據(jù)為研究者們提供了一個前所未有的機會來研究人類疾病的機制。如何有效地利用這些大規(guī)模生物數(shù)據(jù),并從中挖掘出和人類疾病相關(guān)的信息成為了最近研究的一個熱點。已經(jīng)有很多研究者們開始了從大規(guī)模生物數(shù)據(jù)中挖掘疾病相關(guān)基因的研究。例如從序列數(shù)據(jù)出發(fā)根據(jù)疾病基因的序列特征來對其進行探測,或者從表達數(shù)據(jù)出發(fā)根據(jù)疾病基因的表達模式來對其進行探測。在本文中,提出了2個探測疾病相關(guān)基因的方法,并對其進行了詳細的分析。
　　本論文共分為5章,第一章主要對生

3、物信息學領(lǐng)域進行概述。對該領(lǐng)域的研究內(nèi)容,歷史,研究意義和應用進行了簡單介紹。第二章是第三章的基礎.第二章主要介紹了微陣列實驗技術(shù),微陣列數(shù)據(jù)的獲取和數(shù)據(jù)的前處理。在介紹微陣列數(shù)據(jù)的前處理時,本文主要闡述了微陣列數(shù)據(jù)的過濾,缺失值估計和數(shù)據(jù)的標準化。第三章介紹了微陣列數(shù)據(jù)中的生物信息挖掘。對反向工程的模型和基本原理進行了闡述,然后提出了一個利用反向工程算法和隨機行走來探測疾病相關(guān)基因的方法,并對此方法的有效性和可行性進行了討論。第四章介