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文檔簡介
1、目的:IL-23R/IL-17A通路是炎癥性疾病發(fā)生發(fā)展的重要信號(hào)通路,但在冠心病中的作用尚未知。本研究將采用病例對(duì)照關(guān)聯(lián)分析研究方法,探討IL-23R/IL-17A通路與冠心病的相關(guān)性。
方法:我們通過Haploview軟件分別構(gòu)建出IL23R和IL17A基因的連鎖不平衡圖譜(LD Block),選取tag SNPs如下:rs2275913 G>A(IL17A),rs6682925 T>C(IL23R)。我們選取GeneID
2、樣本庫中國中部人群共3950例(2337例CAD vs1613例對(duì)照)和北方人群共2308例(705例CAD vs1603例對(duì)照),運(yùn)用高分辨率溶解曲線技術(shù)(High Resolution Melting,HRM),進(jìn)行了所選SNPs的基因分型,并采用皮爾森(Pearson’s)2x2及2x3列聯(lián)表卡方檢驗(yàn)方法進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。對(duì)計(jì)數(shù)資料(等位基因頻率、性別、吸煙等)采用卡方檢驗(yàn),計(jì)量資料(BMI、年齡、血脂數(shù)據(jù)等)采用t檢驗(yàn),并利用多因素
3、logistic回歸分析對(duì)冠心病傳統(tǒng)危險(xiǎn)因素進(jìn)行校正,若P<0.05認(rèn)為結(jié)果有顯著差異。
結(jié)果:
?。?)在中國中部人群中,等位基因關(guān)聯(lián)分析結(jié)果提示,兩個(gè)SNPs的等位基因分布頻率在病例組和對(duì)照組人群中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(rs2275913,Pobs=0.356,=0.687,OR=1.022,95%CI:0.918-1.139;rs6682925,Pobs=0.135,Padj=0.573,OR=0.969,95%CI
4、:0.870-1.080);基因型關(guān)聯(lián)分析結(jié)果提示,兩個(gè)SNPs基因型分布頻率在病例組和對(duì)照組中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(rs2275913,顯性模式,Pobs=0.079,Padj=0.148,OR=1.128,95%CI:0.958-1.328;隱性模式,Pobs=0.679,Padj=0.338,OR=0.913,95%CI:0.757-1.100;加性模式,Pobs=0.117,Padj=0.691,OR=1.022,95%CI:0.9
5、19-1.137。rs6682925,顯性模式,Pobs=0.085,Padj=0.285,OR=0.918,95%CI:0.785-1.074;隱性模式,Pobs=0.585,Padj=0.751,OR=1.032,95%CI:0.849-1.256;加性模式,Pobs=0.226,Padj=0.584,OR=0.971,95%CI:0.874-1.079)。
(2)在中國北方人群中,等位基因關(guān)聯(lián)分析結(jié)果亦提示,兩個(gè)SNPs
6、的等位基因分布頻率在病例組和對(duì)照組人群中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義
(rs2275913,Pobs=0.942,Padj=0.202,OR=0.895,95%CI:0.755-1.061;rs6682925,Pobs=0.385,Padj=0.463,OR=1.071,95%CI:0.892-1.286);基因型關(guān)聯(lián)分析結(jié)果提示,兩個(gè)SNPs基因型分布頻率在病例組和對(duì)照組中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(rs2275913,顯性模式,Pobs=0.9
7、31,Padj=0.360,OR=0.889,95%CI:0.692-1.143;隱性模式,Pobs=0.811,Padj=0.231,OR=0.825,95%CI:0.601-1.131;加性模式,Pobs=0.957,Padj=0.202,OR=0.895,95%CI:0.754-1.061。rs6682925,顯性模式,Pobs=0.437,Padj=0.648,OR=0.939,95%CI:0.718-1.229;隱性模式,Po
8、bs=0.011,Padj=0.057,OR=1.270,95%CI:0.991-1.893;加性模式,Pobs=0.009,Padj=0.466,OR=1.070,95%CI:0.892-1.283)。
?。?)在合并人群中,兩個(gè)SNPs的等位基因及基因型分布頻率在病例組和對(duì)照組人群中差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(校正后P值均超過0.05);
結(jié)論:在中國漢族人群中,IL-23R/IL-17A通路上關(guān)鍵基因的多態(tài)性位點(diǎn)與冠心病
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