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1、為了研究實(shí)驗(yàn)用動(dòng)物貴州白香豬的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳背景,本研究采用PCR測(cè)序技術(shù)對(duì)貴州白香豬 I系和II系30個(gè)個(gè)體線粒體 DNA D-loop區(qū)全序列和10個(gè)雄性個(gè)體 Y染色體上的SRY基因編碼區(qū)序列進(jìn)行了序列測(cè)定,并結(jié)合GenBank上已發(fā)表的同源序列,進(jìn)行了群體遺傳結(jié)構(gòu)及分子系統(tǒng)發(fā)育分析,得到如下結(jié)果:
1.貴州白香豬線粒體 D-loop區(qū)全長(zhǎng)為1118、1128和1138bp三種不同長(zhǎng)度。A、T、G、C堿基的平均含量分別為3
2、1.6%、24.7%、17.1%和26.6%,A+T含量(56.3%)明顯高于G+C含量(43.7%)。D-loop區(qū)核苷酸多樣性(Pi)為0.00119,平均核苷酸差異數(shù)(k)為1.333。
2.貴州白香豬兩品系的30個(gè)個(gè)體共檢測(cè)到3種線粒體單倍型,GZWXI8、GZWXI12和GZWXII230。I系15個(gè)被檢測(cè)個(gè)體占有全部這三種單倍型,II系15個(gè)被檢測(cè)個(gè)體只占有其中的一種單倍型 GZWXII230。在30個(gè)個(gè)體中,有4
3、個(gè)個(gè)體共享單倍型 GZWXI12,10個(gè)個(gè)體共享單倍型 GZWXI8,16個(gè)個(gè)體共享單倍型GZWXII230,其中包含1個(gè)I系個(gè)體。
3.貴州白香豬 II系15個(gè)被檢測(cè)個(gè)體當(dāng)中只存在1種線粒體單倍型 GZWXII230。I系116號(hào)個(gè)體共享單倍型 GZWXII230,這與II系豬是從 I系豬當(dāng)中選育出來(lái)的培育事實(shí)相符。I系豬中檢測(cè)到較多單倍型,需進(jìn)一步選育提純。
4.I系、II系豬線粒體 D-loop序列與GenBa
4、nk上收錄的49個(gè)豬品種同源序列比對(duì),檢測(cè)到42個(gè)多態(tài)位點(diǎn),界定了57種單倍型。貴州白香豬的兩個(gè)品系與中國(guó)其它地方豬品種沒(méi)有共享單倍型,說(shuō)明貴州白香豬在母系遺傳上具有獨(dú)特的遺傳結(jié)構(gòu)。
5.通過(guò)進(jìn)一步系統(tǒng)發(fā)生育分析,從構(gòu)建的NJ系統(tǒng)樹(shù)和UPGMA系統(tǒng)樹(shù)來(lái)看,57種單倍型可分為A、B兩大類型:以中國(guó)豬種單倍型為主的A類和以歐洲豬種單倍型為主的B類。貴州白香豬處于A類,并單獨(dú)聚為一小類。
6.本研究還檢測(cè)了國(guó)內(nèi)外14個(gè)家豬
5、品種(類群)及中國(guó)野豬,共計(jì)75個(gè)雄性個(gè)體的Y染色體 SRY基因,結(jié)果表明該基因編碼區(qū)序列長(zhǎng)為711bp,檢測(cè)到6個(gè)多態(tài)位點(diǎn),界定了6種單倍型。貴州白香豬 I系和II系的10個(gè)樣本在SRY基因編碼區(qū)未觀察到核苷酸序列變異。與國(guó)內(nèi)其它地方豬品種、5頭中國(guó)野豬的SRY基因同源序列進(jìn)行比對(duì),除個(gè)別個(gè)體有差異外,絕大多數(shù)個(gè)體共享1種單倍型 GZWXI,表明中國(guó)家豬具有共同的父系起源。
7.約克夏(Yorkshire)、杜洛克(Duro
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