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文檔簡介
1、針對PBmice小鼠信息系統(tǒng)功能擴展的需求,文章提出并實現了PBMICE-SR語義檢索框架。檢索框架在PBmice系統(tǒng)基礎上提供了智能獲取數據的方法,提高了試驗研究中數據獲取的效率,避免了人為的操作失誤,使原本需要大量專業(yè)人員進行的信息篩選和知識推理工作可以采用機器自動完成。
文章主要闡述了PBMICE-SR框架在J2EE-SSH架構下,框架核心技術的研究,核心模塊具體的設計與實現,和框架整體的測試分析。框架具體實施分為三
2、個階段,其研究方法和研究成果具體如下:
一、檢索數據準備階段,其核心模塊包括生物元數據自動抽取和抽取數據的RDF統(tǒng)一標記。文章在多分類支持向量機基礎上結合特征詞頻計算模型,設計了生物元數據自動抽取模型DAGSVM-BM25,并利用Weka平臺整合SSH框架對模型進行測試和實現,結果顯示抽取模型的平均召回率和平均查準率都在96%之上。
一、檢索數據載入階段,其核心功能是將準備好的數據載入系統(tǒng)框架。針對生物數據量
3、大且復雜的特點,文章基于面向切面理論,提出了系統(tǒng)邊緣邏輯分離機制,設計并實現了抽取數據載入切面。從系統(tǒng)加載時間和運行時占用資源角度來看,采用邏輯分離機制后,系統(tǒng)的載入時間縮減58.9%,系統(tǒng)運行時資源占用率降低約20%。
三、檢索執(zhí)行階段,這一階段主要設計檢索模型對載入的數據實例進行語義檢索。文章基于SPARQL和OWL技術理論,設計了PBMICE-SR語義檢索模型,并利用Jena框架整合SSH框架進行實現,檢索示例表明語
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