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文檔簡介
1、斑馬魚胚胎圖像神經(jīng)元的檢測作為觀察不同藥物作用效果的重要手段,對藥物篩選的研究有著重要意義。先前的斑馬魚圖像神經(jīng)元分析的研究大多是基于人工標記的感興趣區(qū)域或是專家肉眼檢測的結(jié)果。由于人工觀察和分析較為主觀且煩瑣耗時,不利于重現(xiàn)實驗結(jié)果和分析大量數(shù)據(jù)。因此,有必要研究一種斑馬魚顯微圖像神經(jīng)元自動檢測算法,提高神經(jīng)元檢測的效率。這也為發(fā)展高通量斑馬魚圖像的計算機量化及分析工具奠定基礎。
論文在充分分析斑馬魚圖像特點的基礎上,提
2、出了一套快速、準確的斑馬魚神經(jīng)元自動檢測方案。首先,論文采用了基于形態(tài)學運算的分割方法,將斑馬魚胚胎從背景中分割出來。然后結(jié)合包含神經(jīng)元的感興趣區(qū)域的位置及形態(tài)特點,利用圖像位置校準、分水嶺算法、自適應閾值二值化、邊界曲線擬合及最近鄰域內(nèi)插等五種算法的有機組合自動提取胚胎的感興趣區(qū)域,并統(tǒng)計感興趣區(qū)域的中心線長度及曲率。最后,論文在傳統(tǒng)細胞計數(shù)的圖像標號算法基礎上提出了一種基于連通域跟蹤的神經(jīng)元計數(shù)算法,并與環(huán)形Hough變換檢測神經(jīng)元
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