基因組瀏覽器底層數(shù)據的分析與集成.pdf

1、隨著測序技術的不斷發(fā)展和千人基因組計劃的推動,基因組數(shù)據已經大量出現(xiàn),著眼于全基因組范圍的關聯(lián)研究成果正不斷被發(fā)表出來?；蚪M瀏覽器已成為廣泛應用的工具之一,結合各類生物信息學數(shù)據庫對基因組數(shù)據進行分析是一個有效的方法。如何對基因組數(shù)據進行多方位的深入分析,特別是在疾病方面會對個人產生何種影響是重要的研究課題。針對目前大多數(shù)基因組瀏覽器在疾病藥物相關數(shù)據庫整合方面的欠缺,本文制定了五條標準篩選了疾病藥物相關數(shù)據庫,并通過一個新的文件格式

2、——GDF對這些數(shù)據庫數(shù)據進行融合,運用加權打分和基于信息量的方法對數(shù)據的可信度進行評估,并對評估結果進行比較。通過類似數(shù)據倉庫的方法將數(shù)據集成到一個B/S結構的基因組瀏覽器中,實現(xiàn)了不同的FileReader對不同類型的數(shù)據進行處理,用XML格式作為數(shù)據傳輸格式,通過對系統(tǒng)的部分性能測試發(fā)現(xiàn)其在加載本地服務器數(shù)據時耗費時間很短,具有較好的性能。
　　主要研究成果是:對現(xiàn)有基因組瀏覽器底層數(shù)據類型進行歸納,通過加入疾病藥物相關數(shù)據