致病疫毒群體遺傳結(jié)構(gòu)及無(wú)霉基因Avr3a進(jìn)化分析.pdf

1、摘要摘要致病疫霉[Phytophthorainfestans(Mont)deBary]弓l起的晚疫病，是全世界重要的毀滅性病害之一。目前對(duì)該病防治主要依靠培育抗病品種和使用化學(xué)藥劑，由于化學(xué)防治不僅增加成本且易造成環(huán)境污染，栽培抗病品種是防治晚疫病最經(jīng)濟(jì)有效的方法，但是由于致病疫霉群體易變異性使抗病品種抗性喪失。因此明確致病疫霉的群體遺傳結(jié)構(gòu)和毒性變異規(guī)律，能為尋找新的防病措施、制訂病害治理的策略提供理論依據(jù)。對(duì)采集自寧德周寧郊區(qū)的80

2、個(gè)致病疫霉群體遺傳表現(xiàn)型進(jìn)行研究，結(jié)果顯示：甲霜靈高抗菌株和中抗菌株分別占90％和10％，未發(fā)現(xiàn)甲霜靈敏感菌株；待測(cè)的80個(gè)致病疫霉菌全部是A1交配型，未發(fā)現(xiàn)A2交配型、AlA2交配型和自育型菌株。線粒體DNA(mtDNA)單倍型測(cè)定結(jié)果顯示：Ila單倍型和IIb單倍型菌株分別占待測(cè)菌株的6875％和3125％，未發(fā)現(xiàn)Ia和Ib單倍型。利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)同一地塊不同時(shí)期致病疫霉群體遺傳多樣性進(jìn)行比較分析，結(jié)果表明晚期致病疫霉群體遺

3、傳多樣性高于早期致病疫霉群體。聚類(lèi)分析表明，早期菌株和晚期菌株交叉分布于不同的聚類(lèi)組中，表明SSR分子標(biāo)記技術(shù)不能有效的區(qū)分不同時(shí)期致病疫霉群體。利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)采集自中國(guó)不同地區(qū)不同寄主來(lái)源的60個(gè)致病疫霉群體遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析，結(jié)果表明番茄致病疫霉群體遺傳多樣性高于馬鈴薯致病疫霉群體。馬鈴薯致病疫霉種群與番茄致病疫霉種群遺傳距離為00250，表明致病疫霉分化時(shí)間較短。聚類(lèi)分析表明：馬鈴薯晚疫病菌與番茄晚疫病菌不能完全劃分為兩個(gè)

4、不同的組群，而是交叉分布在不同的組群中。將菌株對(duì)甲霜靈抗性、交配型及mtDNA單倍型結(jié)果與聚類(lèi)結(jié)果結(jié)合起來(lái)分析表明：SSR分子標(biāo)記檢測(cè)的DNA多樣性與病原菌甲霜靈抗性、交配型等無(wú)相關(guān)性，與mtDNA單倍型有一定關(guān)系。對(duì)采集自中國(guó)不同地區(qū)103個(gè)致病疫霉無(wú)毒基因Avr3a進(jìn)行測(cè)序。用ClustalXl81與Dnasp51001軟件對(duì)致病疫霉無(wú)毒基因Avr3a序列多態(tài)性、群體遺傳多樣性及單倍型預(yù)測(cè)數(shù)進(jìn)行檢測(cè)，結(jié)果表明：致病疫霉無(wú)毒基因Avr

5、3a序列多態(tài)性是由于基本的堿基替換(轉(zhuǎn)換、顛換)、插入及缺失引起的，主要突變區(qū)域發(fā)生在109117位堿基處，包括缺失和替換；南方致病疫霉群體遺傳多樣性比北方群體高，致病疫霉無(wú)毒基因Avr3a遵循中性進(jìn)化模型。用TOPALiv25軟件中最小二乘法1V7AbstractThelateblightcausedbyPbtophthorainfestans，isoneoftheworldimportantdevastatingdiseaseDis

6、easepreventionandcontrolisrelymainlyonresistantvarietiesanduseofchemicalagentsincurrentlyFornotonlyincreasethecostofchemicalcontrolbutalsocauseenviromentalpollutionCulturalcontrolofpotatolateblightresistantvarietiesisthe

7、mostcosteffectivemethod，butduetovariable尸infestanspopulations，resistanttothelossofresistantvarietiesClearPinfestanspopulationgeneticstructureandvariationcanfindnewdiseasepreventionmeasurestodevelopsustainablediseasecontr

8、olstrategiesprovideatheoreticalbasisStudyonthegeneticphenotypeofthe80PinfestanscollectedfromtheNingdeZhouningsuburbs，theresultsshowed：highlyresistantstrainsofmetalaxylandresistantstrainsofmetalaxylaccostStbr90％and10％resp

9、ectivelymetalaxylsensitivestrainswasnotfound；the80testedPinfestansallwereA1matingtype，thereWasnotA2matingtype，A1A2matingtypeandselfsterilestrainMitochondrialDNA(mtDNA)haplotypetestshowedthat：IIahaplotypestrainsandIIbhapl

10、otypesaccountedfor6875％and3125％respectivelyIaandIbhaplotypeWasnotfoundAnalysisondifferentperiodsofgeneticdiversityofPinfestanswithSSRmolecularmarkers，theresultsshowedthatthegeneticdiversityofadvancedPinfestansWashigherth

11、anearliergroupsofPinfestansClusteranalysisshowedthat：thestrainsofearlyandlatecTOSS—straindistributioninthedifferentgroups，indicatedthatSSRmarketsCannoteffectivelydistinguishbetweenthedifferentperiodsPinfestanspopulations

12、Analysisonthepopulationgeneticstructureofthe60PinfestanscollectedfromdifferenthostplantsindifferentpartsofChinawitllSSRmolecularmarkers，theresultsshowedthat：thegeneticdiversityoftomatoPinfestanspopulationWashigherthanpot

13、atoPinfestanspopulationsThegeneticdistanceofPotatoPinfestanspopulationandTomatoPinfestanswas00250，indicatedthattheshorterdifferentiationClusteranalysisshowedthat：potatoandtomatoPinfestansCannotbecompletelydividedintotwod