中國內陸鹽湖浮游動物DNA條形碼的構建及其遺傳多樣性分析.pdf

1、浮游動物作為生態(tài)系統(tǒng)中的次級生產(chǎn)力，在生態(tài)系統(tǒng)的物質傳遞和能量循環(huán)中起到至關重要的作用，在食物鏈中能夠將物質和能量由低營養(yǎng)級向高營養(yǎng)級傳遞。其種類組成和數(shù)量變動會對整個生態(tài)系統(tǒng)產(chǎn)生影響。
　　DNA條形碼(DNA barcoding)分子標記的有效技術方法之一，可以快速準確進行物種鑒定。COI基因是線粒體基因組中的進化速度比較穩(wěn)定的基因之一，有利于設計出通用引物，并且大多數(shù)物種的COI基因能夠成功擴增出來，進而有利于把COI基因作

2、為物種的DNA條形碼。在環(huán)境、生態(tài)、生物多樣性保護、食品安全、海關檢疫以及疾病防控等領域均得到廣泛應用。
　　本文對中國內陸鹽水浮游動物的COI基因序列片段進行擴增、測序，分析其線粒體COI基因片段序列特征構建分子系統(tǒng)發(fā)育樹，旨在探討將線粒體COI基因作為DNA條形碼用于中國內陸鹽水浮游動物分類鑒定的有效性和可行性，并在為其生物進化的歷史和適應潛力提供基礎數(shù)據(jù)。
　　通過基于COI基因構建內陸鹽湖浮游動物DNA條形碼數(shù)據(jù)庫，

3、獲得18個優(yōu)勢種共58條COI序列。其中直額裸腹溞、矩形尖額溞、蒙古裸腹溞、咸水北鏢水蚤、英勇劍水蚤、草綠刺劍水蚤、短角異劍水蚤等的COI基因部分序列都是首次被克隆出來，為今后相關物種的研究提供強有力的依據(jù)。研究結果表明，裸腹溞科種間遺傳距離平均值為18.2％。對32條蒙古裸腹溞COI序列，通過序列比對拼接后，序列長度均為709bp，翻譯出235個氨基酸。在所得的32條蒙古裸腹溞序列中，平均堿基含量順序為T>A>C>G。其中四種堿基中T

4、（37.66%）的平均含量最高，而C（16.08%）的平均含量最低，A+T的含量（62.48%）明顯高于G+C的含量（37.52%），具有AT堿基偏好性，種內遺傳差異不明顯。圓形盤腸溞6個地理種群兩兩之間的遺傳距離最小的為0.4%，最大的距離已經(jīng)達到11.9%已經(jīng)遠遠達到物種劃分的閾值標準。劍水蚤科的平均遺傳距離為28.3%，其中短角異劍水蚤（Apocyclops royi）與真劍水蚤屬的遺傳距離最大（36.8%），遺傳距離最小的是Cy

5、clopidae sp.與Macrocyclops albidus（20.3%），總的來說同屬的劍水蚤遺傳距離要比不同屬間的遺傳距離小。
　　總之，DNA條形碼鑒定的結果和形態(tài)學結果是基本上一致的，而且在區(qū)分姊妹種方面要優(yōu)于傳統(tǒng)方法。本研究構建我國內陸鹽水浮游動物優(yōu)勢種對應的mtCOI序列數(shù)據(jù)庫，為我國內陸鹽水浮游動物積累些背景數(shù)據(jù)。并在此基礎上，探索物種的遺傳多樣性，并與形態(tài)學鑒定結果進行對比，確定用分子生物學手段來快速、標準化