太平洋七鰓鰻遺傳多樣性的分析.pdf

1、本研究共收集218個(gè)太平洋七鰓鰻成體樣品，分別來自美國John DayRiver(JD)，Klamath River(KLA)，Moose River Weir(MRW)，Willamette River(WR)，North Fork Toutle River(NFT)，Rogue River(RR)，Deschutes River(DR)等七個(gè)河流和日本的Naka River(NR)河流。 在AFLP 技術(shù)研究中采用7 對選擇

2、性引物對太平洋七鰓鰻8個(gè)種群進(jìn)行分析，共檢出556個(gè)位點(diǎn)，平均每個(gè)引物擴(kuò)增出79.4個(gè)的位點(diǎn)，其中多態(tài)性位點(diǎn)達(dá)到180個(gè)(32.4％)，多態(tài)位點(diǎn)比例分布在12.7％－40.5％之間。在SSR 技術(shù)研究中，5 對SSR 引物共擴(kuò)增出17個(gè)等位基因，平均的有效等位基因數(shù)(Ne)為3.4。各位點(diǎn)的多態(tài)信息含量范圍0.291－0.763，平均多態(tài)信息含量為0.451。在種群雜合度檢測中，SSR的檢測結(jié)果為0.429－0.565，明顯高于AFLP

3、的檢測結(jié)果0.066－0.111，說明SSR 技術(shù)檢測到的變異性明顯高于AFLP 技術(shù)。 兩種方法的AMOVA分析和成對的遺傳分化系數(shù)Fst的比較都顯示出來自不同地理區(qū)域的七鰓鰻種群的遺傳變異主要源于群體內(nèi)的個(gè)體間，個(gè)體間的遺傳分化較大，而群體間的遺傳多樣性小，存在較大的基因流動。同時(shí)，運(yùn)用Structure 軟件將8個(gè)種群分為6個(gè)類群，結(jié)果每個(gè)群體在不同的組里所占比例明顯不同，說明群體間有頻繁的雜交與基因滲透。 利用AF

4、LP和SSR兩種分子標(biāo)記獲得太平洋七鰓鰻8個(gè)不同地理群體之間的Nei’s 遺傳距離，并根據(jù)遺傳距離構(gòu)建NJ 聚類樹。兩種方法的聚類結(jié)果基本一致：日本(NR)、阿拉斯加(MRW)兩個(gè)種群與其它太平洋東北部種群的分歧最為明顯；而位于哥倫比亞河流域附近的太平洋東北部六個(gè)群體中，除WR和NFT兩個(gè)群體有明顯聚類外，RR、KLA和JD 三個(gè)種群的聚類也比較穩(wěn)定。通過AFLP和SSR兩種技術(shù)所獲得遺傳多樣性的相關(guān)數(shù)據(jù)顯示，太平洋七鰓鰻種群結(jié)構(gòu)很難用