長(zhǎng)壯蝎蝽和斑衣蠟蟬線(xiàn)粒體基因組測(cè)序及分析(昆蟲(chóng)綱：半翅目).pdf

1、本研究旨在獲得異翅亞目和蠟蟬亞目代表類(lèi)群線(xiàn)粒體基因組的核苷酸序列及基因排序等信息，為后續(xù)解析廣義半翅目的畢業(yè)線(xiàn)粒體結(jié)構(gòu)和分子系統(tǒng)發(fā)育研究提供基礎(chǔ)科學(xué)數(shù)據(jù)。
　　 本研究測(cè)定了長(zhǎng)壯蝎蝽和斑衣蠟蟬線(xiàn)粒體基因組序列，二者均為雙鏈環(huán)狀分子，包含典型的節(jié)肢動(dòng)物線(xiàn)粒體基因組的37個(gè)基因，分別為13個(gè)蛋白質(zhì)基因、22個(gè)tRNA基因和2個(gè)rRNA基因，和1個(gè)A+T豐富區(qū)。兩種昆蟲(chóng)線(xiàn)粒體基因組特點(diǎn)如下：
　　 1.長(zhǎng)壯蝎蝽和斑衣蠟蟬37個(gè)

2、線(xiàn)粒體基因排序和典型的節(jié)肢動(dòng)物完全相同。二者基因組結(jié)構(gòu)緊密，除（A+T）豐富區(qū)外，基因間所有非編碼序列總長(zhǎng)度最多只有43bp，甚至在9或12對(duì)基因之間存在著基因重疊現(xiàn)象。
　　 2.長(zhǎng)壯蝎蝽和斑衣蠟蟬線(xiàn)粒體基因組的兩條鏈上存在著嚴(yán)重的堿基偏向，其中蠟蟬具有更加顯著的AT堿基偏向。兩種昆蟲(chóng)線(xiàn)粒體由H鏈編碼的基因，堿基A含量普遍高于T含量，堿基C含量均高于G含量，由L鏈編碼的基因四種堿基含量完全與H鏈相反。以此推測(cè)分布在2條鏈上的基

3、因在進(jìn)化中所承受的選擇壓力是不同。
　　 3.兩種昆蟲(chóng)線(xiàn)粒體氨基酸和密碼子的使用都具有強(qiáng)烈的偏向性。主要表現(xiàn)在NNU和NNA形式的密碼子相對(duì)含量（RSCU值）在每種氨基酸密碼子中皆占絕對(duì)主導(dǎo)地位，相反NNC和NNG形式的密碼子相對(duì)含量普遍偏低，說(shuō)明這種密碼子使用的偏向性主要是由密碼子第3位點(diǎn)堿基的偏向性決定的。還發(fā)現(xiàn)在所有使用的氨基酸中疏水性氨基酸占據(jù)了一多半的比例，這和線(xiàn)粒體基因組編碼蛋白質(zhì)的功能相關(guān)。
　　 4.長(zhǎng)壯

4、蝎蝽與斑衣蠟蟬線(xiàn)粒體13個(gè)蛋白質(zhì)基因的起始密碼子都使用了通用的ATN作為起始密碼子。兩種昆蟲(chóng)蛋白質(zhì)編碼基因開(kāi)放閱讀框的終止密碼子多數(shù)是不完整的T-tRNA或T。
　　 5.長(zhǎng)壯蝎蝽與斑衣蠟蟬線(xiàn)粒體22個(gè)tRNA基因的反密碼子和多數(shù)節(jié)肢動(dòng)物一致，它們的二級(jí)結(jié)構(gòu)除了tRNA-Ser（GCU）缺失了DHC莖環(huán)結(jié)構(gòu)外，都可以折疊成典型的三葉草結(jié)構(gòu)，其中氨基酸受體莖和反密碼子莖、環(huán)結(jié)構(gòu)相對(duì)保守，而DHU莖環(huán)、TψC莖環(huán)和可變環(huán)的變異較大，