海洋超微型浮游生物分子生態(tài)學(xué)研究.pdf

1、本文運(yùn)用16S rRNA基因、功能基因(rpoC1)克隆文庫構(gòu)建、限制性酶切片段長度多態(tài)性(RFLP)分析和變性梯度凝膠電泳(DGGE)技術(shù)對(duì)中國典型海區(qū)(中國南海、東海)和東北太平洋海區(qū)超微型浮游生物(主要是藍(lán)細(xì)菌和異養(yǎng)細(xì)菌)的種群結(jié)構(gòu)、動(dòng)態(tài)變化及其與環(huán)境間的關(guān)系進(jìn)行了研究.主要研究結(jié)果如下:1.中國南海存在大量遺傳多樣性豐富的原綠球藻和聚球藻,冬季在該海區(qū)發(fā)現(xiàn)的原綠球藻屬于高光適應(yīng)型Ⅱ型(HLⅡ),HLII型原綠球藻是該海區(qū)的優(yōu)勢(shì)基

2、因型.該海區(qū)的聚球藻可分成2個(gè)較大分枝,均屬M(fèi)C-A(marine cyanobacterial A)組,多與非運(yùn)動(dòng)型的聚球藻菌株聚為一類.這些聚球藻與世界不同海區(qū)分離的聚球藻關(guān)系較近(序列相似性90﹪-98﹪).2.中國南海不同斷面的細(xì)菌種類變化不大,但各類細(xì)菌在數(shù)量上有差異.藍(lán)細(xì)菌在該海區(qū)含量豐富.異養(yǎng)細(xì)菌以γ-變形菌亞綱和α-變形菌亞綱為主,未發(fā)現(xiàn)在淡水環(huán)境中廣泛存在的β-變形細(xì)菌.其它還有較多的CFB組細(xì)菌和放線菌,還檢測(cè)到一些

3、低G+C含量的厚壁菌類.3.中國東海沿PN斷面(從河口到外海)細(xì)菌種群結(jié)構(gòu)發(fā)生不同程度的改變.在近河口區(qū)細(xì)菌種類比較豐富但優(yōu)勢(shì)類群不明顯,至陸架區(qū),細(xì)菌優(yōu)勢(shì)類群發(fā)生改變,且優(yōu)勢(shì)類群數(shù)量增多.在近外海區(qū),細(xì)菌優(yōu)勢(shì)類群較為單一.東海陸架區(qū)50﹪透光層(8m)原綠球藻優(yōu)勢(shì)類群也是高光Ⅱ型.4.對(duì)東北太平洋(13°N,104°W)細(xì)菌的垂直變化進(jìn)行了研究.在該區(qū)域檢測(cè)到的細(xì)菌主要有α-、γ-、和δ-變形菌,藍(lán)細(xì)菌(原綠球藻和聚球藻),CFB組細(xì)

4、菌和高G+C含量的革蘭氏陽性菌,還檢測(cè)到一些真核藻葉綠體的16S rDNA序列.未檢測(cè)到β-變形菌.其中,γ-亞綱細(xì)菌是各層深度的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌,在2850m處(距海底200m)幾乎全是γ-亞綱細(xì)菌.α-亞綱是第2優(yōu)勢(shì)細(xì)菌,在透光層豐富,但在2850m數(shù)量很少.δ-變形菌出現(xiàn)在中間兩層(100m和1000m),在表層和底層均未檢測(cè)到或含量極少.在中間兩層還檢測(cè)到一些高G+C含量的革蘭氏陽性菌.未發(fā)現(xiàn)CFB組細(xì)菌與取樣深度間有明顯相關(guān)性.藍(lán)細(xì)菌