SpltMNPV和SeMNPV基因組Oligo芯片的制作.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、甜菜夜蛾核多角體病毒(Spodopteraexiguamultiplenucleopolyhedrovirus，SeMNPV)和斜紋夜蛾核多角體病毒(Spodopteralituramultiplenucleopolyhedrovirus，SpltMNPV)的全序列分別于1999年和2001年被測定，這為SeMNPV與SpltMNPV在結構基因組水平上的研究以及功能基因組學、轉錄組學的研究提供了重要信息，本研究擬在此基礎上制備這兩種病毒

2、的基因表達譜芯片。 根據(jù)SeMNPV和SpltMNPV在NCBI中的基因組全序列信息，利用Oligo軟件分析了兩個病毒基因組全部280個ORF的cDNA和PCR產(chǎn)物片段，建立了兩種病毒各ORF探針及相關信息數(shù)據(jù)庫。對于每個ORF，分別選取60mer長度的寡核苷酸鏈作為該ORF的特異性探針。將合成的探針打印在玻片上，完成了SpltMNPV和SeMNPV全基因組表達譜芯片的制備。提取SeMNPV感染18h后的甜菜夜蛾細胞Se301

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