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文檔簡(jiǎn)介
1、背景:最近一項(xiàng)大型的全基因組關(guān)聯(lián)性研究的薈萃分析證實(shí)了酪氨酸蛋白激酶(Protein tyrosine kinases2 beta,PTK2B)基因可增加高加索人群中阿爾茨海默?。ˋlzheimer’s disease, AD)的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)??紤]到種族異質(zhì)性,我們旨在探討中國北方漢族人群中 PTK2B基因多態(tài)性與遲發(fā)型阿爾茨海默病(late-onset Alzheimer’s disease,LOAD)發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性。
方法:
2、采用病例-對(duì)照研究方法,選取984例散發(fā)的LOAD患者作為病例組,1354例年齡、性別相匹配的健康人群作為對(duì)照組,研究對(duì)象均為北方漢族人群。我們使用全血DNA提取試劑盒提取外周血白細(xì)胞的DNA,采用多重?zé)晒釶CR技術(shù)對(duì)PTK2B基因 rs28834970位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,運(yùn)用聚合酶鏈?zhǔn)健B接酶檢測(cè)反應(yīng)技術(shù)(PCR-LCR)進(jìn)行載脂蛋白(apolipoprotein E,APOE)基因(rs429358和rs7412)分型。應(yīng)用卡方檢驗(yàn)研
3、究 PTK2B基因 rs28834970位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率與LOAD的相關(guān)性。同時(shí)將年齡、性別、APOEε4攜帶狀態(tài)作為協(xié)變量后,采用Logistic回歸方法研究PTK2B基因多態(tài)性rs28834970與LOAD的相關(guān)性。同時(shí),為了盡量減少樣本量、種族差異等因素對(duì)試驗(yàn)結(jié)果所帶來的偏倚,我們對(duì)1968年8月至2017年2月期間收錄于PubMed數(shù)據(jù)庫中所有相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行了系統(tǒng)檢索,納入的研究類型為病例對(duì)照研究。結(jié)合本次實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),采用
4、固定效應(yīng)模型及逆方差加權(quán)法對(duì)基因的疊加模型進(jìn)行分析來探討PTK2B基因多態(tài)性rs28834970與LOAD的相關(guān)性。隨后,為了探討APOE基因在北方漢族人群中對(duì)PTK2B基因多態(tài)性與LOAD相關(guān)性的影響情況,我們先是采用條件性Logistic回歸方法進(jìn)行了PTK2B基因與APOE基因之間的交互作用與LOAD發(fā)病率之間關(guān)系的分析,此時(shí),我們將年齡、性別納入作為協(xié)變量。隨后,我們又根據(jù) APOEε4攜帶情況將研究對(duì)象進(jìn)行分層,應(yīng)用卡方檢驗(yàn)研
5、究PTK2B基因rs28834970位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率與LOAD的相關(guān)性。同時(shí)將年齡、性別作為協(xié)變量后,采用 Logistic回歸方法研究 PTK2B基因多態(tài)性rs28834970與LOAD的相關(guān)性,以此來更加深入地分析APOE基因?qū)TK2B基因多態(tài)性與LOAD相關(guān)性的影響。
結(jié)果:我們共招募了984例散發(fā)的LOAD患者及年齡、性別與之相匹配的健康對(duì)照人群。與對(duì)照組相比,病例組的簡(jiǎn)易精神狀態(tài)量表(Mini-Menta
6、l State Examination score,MMSE)的評(píng)分偏低(P〈0.01),且 APOEε4等位基因頻率偏高(P〈0.01)。在總體樣本中,盡管病例組中 rs28834970的最小等位基因 C的頻率比對(duì)照組高(26.52%vs.24.74%),但 PTK2B基因多態(tài)性 rs28834970位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率與LOAD的相關(guān)性無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。并且,應(yīng)用三種遺傳模型的條件性Logistic回歸也并未發(fā)現(xiàn)r
7、s28834970與LOAD的相關(guān)性(顯性模型, OR=1.148,95%CI=0.970–1.359, P=0.108;隱性模型, OR=1.151,95%CI=0.833–1.590, P=0.394;疊加模型, OR=1.117,95%CI=0.977–1.276, P=0.105)。然而,82513例樣本量的薈萃分析結(jié)果顯示PTK2B基因的rs28834970可以提高LOAD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.09,95%CI=1.07–1.
8、12)。此外,在攜帶APOEε4的研究對(duì)象中,rs28834970的等位基因頻率在病例組與對(duì)照組之間存在差異(P=0.027, OR=1.423,95%CI=1.041–1.945)。同時(shí),將年齡、性別作為協(xié)變量后的Logistic回歸分析結(jié)果顯示,在疊加模型中rs28834970位點(diǎn)與LOAD存在關(guān)聯(lián)性(P=0.041, OR=1.384,95%CI=1.014–1.891)。
結(jié)論:PTK2B基因多態(tài)性rs28834970
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