基于功率譜分析的蛋白編碼區(qū)預(yù)測(cè)方法的研究.pdf

1、基因識(shí)別是生物信息學(xué)的一個(gè)重要分支，隨著計(jì)算機(jī)科技的飛速發(fā)展，將其應(yīng)用到基因識(shí)別中有很重要的現(xiàn)實(shí)意義。論文中首先闡述了基因識(shí)別的重要性、主要研究方法及目前國(guó)內(nèi)外的研究現(xiàn)狀，在深入分析和比較幾種經(jīng)典的功率譜估計(jì)方法的特點(diǎn)和各自的優(yōu)缺點(diǎn)后，著重研究了基于AR模型預(yù)測(cè)DNA序列蛋白編碼區(qū)的問題。介紹了運(yùn)用AR模型進(jìn)行譜估計(jì)的方法以及基于AR模型的蛋白編碼區(qū)估計(jì)的技術(shù)和方法；分析了有關(guān)參數(shù)對(duì)編碼區(qū)預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性的影響。運(yùn)用仿真軟件MATLAB建立了

2、仿真系統(tǒng)，并用計(jì)算機(jī)仿真實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了有關(guān)算法并獲得了相關(guān)結(jié)論。
　　之后，我們還研究了基于FFT預(yù)測(cè)蛋白編碼區(qū)方法的FPGA實(shí)現(xiàn)工作，為以后研發(fā)便攜式的蛋白編碼區(qū)預(yù)測(cè)儀做了一些有益的嘗試。我們首先簡(jiǎn)單介紹了目前硬件開發(fā)工作的流程，主要FPGA芯片提供商Xilinx公司的Spartan-3的內(nèi)部結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)資源情況，然后，重點(diǎn)研究了基于FPGA的預(yù)測(cè)DNA序列蛋白編碼區(qū)的實(shí)現(xiàn)方法，詳細(xì)闡述應(yīng)用ISE開發(fā)平臺(tái)、Modelsim仿真工具、S