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文檔簡介
1、本文主要從以下兩個部分展開論述:
第一部分 KIR基因多態(tài)性與強直性脊柱炎的易感性研究
目的:
強直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)是一種慢性炎癥性的自身免疫性疾病,其發(fā)病機制目前尚不明確。除了HLA-B27之外,近幾年發(fā)現(xiàn)殺傷細胞免疫球蛋白樣受體(killer cell immunoglobulin-like receptor,KIR)基因與AS也存在一定的相關性。但研究結(jié)果
2、存在一定的矛盾。因此,本研究對浙南地區(qū)AS患者和健康對照的KIR基因分布進行分析,探討KIR基因在AS中的作用。
方法:
1.收集浙南地區(qū)無血緣關系的AS患者和健康對照的EDTA-K2抗凝的外周血標本,分別為99例和100例,提取脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)。
2.用序列特異性引物聚合酶鏈反應(Polymerase chain reaction withsequence
3、-specific primers,PCR-SSP)的方法對16種KIR基因進行檢測。
3.根據(jù)KIR所帶基因種類和數(shù)目的不同,將KIR基因型分為抑制性基因型(AA型)和非抑制性基因型(AB型和BB型),并對KIR基因型進行編號。
4.計算KIR基因表型頻率、基因頻率及基因型頻率,分析AS患者和健康對照的KIR基因分布情況。用x2檢驗或者Fisher確切概率法比較AS患者和健康對照各KIR基因頻率和基因型頻率是否存在
4、差異。
5.計算KIR單體型頻率,用x2檢驗或者Fisher確切概率法分析其在AS患者和健康對照組之間是否存在差異。
結(jié)果:
1.所有AS患者均存在2DL1、2DL3、2DL4、3DL2、3DL3基因及假基因2DP1和3DP1。共有28種基因型,其中AA1型比例最高(35.35%),其次為BX2型(13.13%)。
2.AS患者活化性基因KIR2DS3的基因頻率明顯高于健康人群(39.39% vs
5、21%,x2=7.992,P<0.01)。
3.AS患者抑制性基因型(AA型)頻率明顯低于健康人群(P<0.05),但兩組之間單倍體型比例不存在明顯差異(P=0.256)。
結(jié)論:
活化性基因KIR2DS3在AS患者中的表型頻率明顯高于健康對照組,且AS患者活化性和抑制性KIR基因比例失衡,出現(xiàn)免疫活化的傾向,可能與AS的發(fā)生有一定的關系。
第二部分 miR-146a、miR-499單核苷酸多態(tài)性
6、與強直性脊柱炎的相關性研究
目的:
miRNAs是一種能夠在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)多種靶基因表達的非編碼小RNAs。在miRNA序列上的單核酸多態(tài)性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)能夠影響miRNA的表達。并且,有研究表明其與許多關節(jié)炎性疾病的致病作用有關,如類風濕關節(jié)炎和骨關節(jié)炎。miR-146a和miR-499 SNPs與AS的相關性研究目前尚未見報道,故本研究首次探討它們之間的聯(lián)
7、系,從而為AS的發(fā)病機制提供理論依據(jù)。
方法:
1.收集102例AS患者(未用藥物治療)及105例健康對照EDTA-K2抗凝血標本,提取DNA。
2.用測序法直接檢測miR-146a各SNPs(rs2910164,rs57095329、rs6864584、rs2431697、rs2277920)及miR-499 rs3746444。
3.用x2檢驗分析各SNPs基因型頻率分布是否符合Hardy-W
8、einberg平衡。AS患者和健康對照的基因型頻率和等位基因頻率比較采用x2檢驗或者Fisher確切概率法。采用PASS11.0計算檢驗效能。
4.我們采用Kruskal-Wallis H檢驗或者ANOVA檢驗對各SNP不同基因型之間的AS患者外周血中C反應蛋白(CRP)和血沉(ESR)水平進行比較,判斷不同基因型之間這兩個指標是否存在差異。
結(jié)果:
1.AS患者和健康對照各SNP基因型頻率均符合Hardy
9、-Weinberg平衡(P值均大于0.05).
2.我們發(fā)現(xiàn)miR-146ars2910164與AS存在相關性。AS組G等位基因頻率(49.0% vs.35.2%,P=0.005, Pc=0.01, OR=1.767,95%CI=I.191~2.621)和GG基因型頻率(24.5% vs.11.4%,P=0.014,Pc=0.042,OR=2.516,95%CI=1.187~5.336)明顯高于健康對照組。
3.mi
10、R-146a rs57095329、rs6864584、rs2431697、rs2277920 SNPs各基因型頻率和等位基因頻率在AS患者和健康對照組間不存在顯著性差異(P值均大于0.05)。
4.miR-499 rs3746444 T/C SNP等位基因頻率(P=0.369,power=15%)和基因型頻率(Pc>0.05,power=37%)在AS患者和健康對照組之間也不存在顯著性差異。
5.基因連鎖分析發(fā)現(xiàn)m
11、iR-146a rs57095329和rs2277920存在較強的連鎖關系(D'=0.904,r2=0.708);miR-146a5種SNPs共構(gòu)建了19種單體型,其中CATTT單體型(rs2910164/rs57095329/rs6864584/rs2431697/rs2277920)在AS患者中的頻率明顯低于健康對照組(39.9% vs53.6%,x2=6.576,P=0.01,OR=0.574,95%CI=0.375~0.879)
12、;而GGTTC單體型(rs2910164/rs57095329/rs6864584/rs2431697/rs2277920)頻率在AS組明顯高于健康對照(27.7% vs14.9%,x2=8.792,P=0.003,OR=2.192,95%CI=1.296~3.707)。
6.miR-146a SNPs各基因型的AS患者外周血中CRP和ESR水平不存在顯著性差異。AS患者外周血中CRP和ESR水平在miR-499各基因型之間也
13、不存在顯著性差異。
結(jié)論:
我們首次證實了miR-146a G等位基因和GG基因型是AS的危險因素。該SNP可能可以作為AS鑒定的候選指標。miR-146a rs57095329、rs6864584、rs2431697、rs2277920和miR-499 rs3746444可能與AS不存在相關性,但還需要大樣本實驗進一步驗證。GGTTC單體型可能是AS的危險因素,而CATTT單體型可能是一個保護性因素。另外,這兩個m
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