中藥方劑桃仁紅花煎的計算藥理學研究.pdf

1、桃仁紅花煎，是中藥典籍《素庵醫(yī)案》中記載的一則經典方劑，由桃仁﹑紅花﹑當歸﹑香附﹑延胡索﹑赤芍﹑川芎﹑丹參﹑青皮﹑生地黃十味藥物組成。臨床研究表明其對心血管疾病有較好的治療作用，然而其具體的藥理學研究很少。中藥方劑的藥理學研究對于中藥現(xiàn)代化十分重要。如何從中草藥化合物中篩選出相關靶標的潛在活性化合物是一個非常重要的研究課題，能否從分子水平闡述中藥治療相關疾病的作用機制也是一個研究熱點。
　　本文主要利用計算機輔助藥物設計的方法對桃

2、仁紅花煎進行了研究，包括以下三部分：
　　第一，通過查閱文獻得到桃仁紅花煎中的672種化合物小分子，計算其化學描述符，并對描述符進行分析。然后通過主成分分析研究，并與112個治療心血管疾病的藥物/類藥分子比較。我們利用主成分分析的方法將兩類分子的化學空間映射到二維和三維空間，進行化學空間分析。
　　第二，基于分子對接的虛擬篩選。首先，利用分子對接方法將672個桃仁紅花煎中含有的小分子與29種與心血管疾病有關的蛋白質靶標（47

3、個結合位點）對接打分，篩選得分較高的活性分子。其次，構建了小分子-蛋白質網絡圖，并計算Degree和Betweeness值，根據Degree的值篩選出了15種活性成分，其中有11種分子被報道具有抗氧化﹑抗炎等生理活性。
　　第三，精細對接。以上篩選出的15種小分子中的9個分子與部分靶標利用軟件AutoDock對做進一步對接，通過研究分子與靶標間的結合作用及相關對接數(shù)據，印證虛擬篩選結果的正確性，從分子水平上闡述了桃仁紅花煎治療心血