日本沼蝦不同地理群體遺傳多樣性與分子標記鑒別研究.pdf

1、日本沼蝦(Macrobrachium nipponense)自然分布于中國、日本、越南以及緬甸等地區(qū)，廣泛分布于我國各地淡水水域。這一物種資源量在長江中下游地區(qū)是非常豐富的，特別是太湖地區(qū)。該品種在中國和日本是重要的淡水經濟蝦類。近年來，由于過度捕撈，自然棲息地的退化使得日本沼蝦野生群體的種群遺傳結構和資源量急劇下降。因而開展遺傳多樣性分布和野生群體遺傳結構的研究對制定保護措施顯得尤為重要。
　　利用ISSR分子標記技術對江蘇長江

2、和太湖2個地區(qū)日本沼蝦群體的遺傳多樣性進行了分析。結果顯示：75個ISSR引物中有6個引物能擴增出清晰條帶，6個引物對兩個群體各24個樣品擴增出34個位點。日本沼蝦長江和太湖兩群體的多態(tài)位點比率為76.47％和73.53％，Shannon’s指數分別為0.3480和0.3465，Shannon's指數估算和AMOVA分析均顯示日本沼蝦的遺傳變異主要來自于群體內個體間。日本沼蝦UPGMA系統樹基本依據不同群體分別聚類，表現出一定的遺傳趨異

3、。結果表明：兩個地區(qū)日本沼蝦群體的遺傳多樣性處于較高水平：日本沼蝦江蘇地區(qū)長江和太湖兩個群體間存在一定的遺傳分化。
　　采用AFLP技術分別對太湖、長江日本沼蝦群體各30尾的基因組DNA進行了群體特異性位點比對分析，并對各位點基因頻率分布進行正態(tài)性檢驗、方差齊性檢驗(F檢驗)、樣本平均數差異顯著性檢驗(t檢驗)。結果顯示：3對引物共擴增出138個位點；太湖組是獨立于長江組的群體，而且它們是兩個分化了的野生群體；采用變異性的顯著性檢

4、驗(x2檢驗)對位點進行差異比較發(fā)現，23個位點在太湖組中出現的頻率顯著高于長江組，其中位點BY160、BY320、BY470、BY520是與太湖群體分化顯著關聯的位點，可作為區(qū)別太湖野生群體與長江野生群體的標記。
　　對我國江蘇省4水域日本沼蝦40個野生個體的線粒體細胞色素氧化酶亞基I(COI)部分序列進行了測定和分析。經比對獲得640bp核苷酸片段，發(fā)現36個變異位點，得到19個單倍型，包括4個共享單倍型，各群體都具有較好的單