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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
1.研究早期肺腺癌患者基因編碼區(qū)的RNA編輯現(xiàn)象。
2.研究腺苷脫氨酶1(Adenosine Deaminases that Act on RNA1,ADAR1)、腺苷脫氨酶2(Adenosine Deaminases that Act on RNA2,ADAR2)和鳥氨酸脫羧酶(Ornithine Decarboxylase,ODC)在肺腺癌中表達(dá)的臨床意義及預(yù)后價(jià)值。
3.研究抗酶蛋白抑制因子1
2、(Antizyme inhibitor1,AZIN1)的RNA編輯對(duì)A549細(xì)胞增殖與轉(zhuǎn)移的影響。
方法:
1.應(yīng)用微流控芯片多重聚合酶聯(lián)反應(yīng)與 RNA測(cè)序( microfluidics-based multiplex PCR and RNA sequencing)檢測(cè)早期肺腺癌患者基因編碼區(qū)的RNA編輯現(xiàn)象。應(yīng)用熒光定量PCR(RT-qPCR)檢測(cè)肺腺癌腫瘤組織與癌旁正常組織中ADAR1、ADAR2和ODC的基因表
3、達(dá)水平。
2.應(yīng)用免疫組織化學(xué)染色技術(shù)檢測(cè)ADAR1、ADAR2和ODC蛋白在肺腺癌腫瘤組織與癌旁正常組織中的表達(dá),分析ADAR1與ODC在肺腺癌中表達(dá)的相關(guān)性和預(yù)后價(jià)值。
3.構(gòu)建穩(wěn)定表達(dá)編輯型AZIN1基因的A549細(xì)胞(A549-edt/AZIN1)和穩(wěn)定表達(dá)野生型AZIN1基因的A549細(xì)胞(A549-wt/AZIN1)。應(yīng)用XTT實(shí)驗(yàn)和Transwell細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn),研究AZIN1的RNA編輯對(duì)于A549增
4、殖和侵襲的影響,應(yīng)用免疫印跡法檢測(cè)ODC蛋白的表達(dá)水平。
結(jié)果:
1.相對(duì)于癌旁正常組織,肺腺癌組織的RNA編輯水平升高。在肺腺癌腫瘤組織編輯水平最高的20個(gè)基因中,在基因編碼區(qū)的共涉及14個(gè)基因位點(diǎn),包括:COG3,SRP9,COPA,SRP9,CACNA1D,RICTOR,ZNF669,METTL6, FLNA,AZIN1,C20orf30,PODXL,F(xiàn)LNB,PDZD7。
2. ADAR1基因和 O
5、DC基因在肺腺癌腫瘤組織中的表達(dá)顯著高于癌旁正常組織,P<0.05。ADAR2基因在肺腺癌腫瘤組織中的表達(dá)與癌旁正常組織無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,其中P>0.05。
3. ADAR1蛋白定位于細(xì)胞核,呈棕黃色或棕褐色顆粒。60.4%的肺腺癌組織ADAR1高表達(dá),而癌旁正常組織僅20.8%為高表達(dá),兩組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。ADAR1蛋白的表達(dá)與肺腺癌患者的TNM分期和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況明顯相關(guān)(P<0.05);而與性別、年齡、吸煙
6、史、胸膜侵犯情況、腫瘤最大直徑和分化程度無明顯相關(guān)(P>0.05)。
4. ADAR2蛋白定位于細(xì)胞核,呈棕黃色或棕褐色顆粒。10.4%的肺腺癌組織ADAR2高表達(dá),而癌旁正常組織中8.3%為高表達(dá),兩組差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
5. ODC蛋白主要定位于細(xì)胞質(zhì),細(xì)胞漿呈棕黃色。56.3%的肺腺癌組織 ODC高表達(dá),而癌旁正常組織僅12.5%為高表達(dá),兩組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。ODC蛋白的表達(dá)與
7、肺腺癌患者的TNM分期明顯相關(guān)(P<0.05);而與性別、年齡、吸煙史、胸膜侵犯情況、腫瘤最大直徑、分化程度和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況無明顯相關(guān)(P>0.05)。
6.經(jīng)過秩相關(guān)性分析,肺腺癌患者中ADAR1與ODC的表達(dá)呈正相關(guān)(r=0.832, P<0.01)。生存分析顯示ADAR1與ODC的表達(dá)與預(yù)后相關(guān)。Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型進(jìn)行多因素生存分析顯示,ADAR1蛋白表達(dá)水平、TNM分期是影響肺腺癌患者預(yù)后的獨(dú)立因素。
7
8、.通過XTT實(shí)驗(yàn)測(cè)試A549、A549-edt/AZIN1和A549-wt/AZIN1的增殖能力。第一天,三組細(xì)胞增殖未出現(xiàn)明顯的差異。第三天, A549-edt/AZIN1與A549-wt/AZIN1的增殖速度明顯高于 A549( P<0.05)。第六天, A549-edt/AZIN1的增殖速度明顯高于A549-wt/AZIN1(P<0.05)。
8.通過Transwell細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn),比較A549,A549-edt/AZI
9、N1和A549-wt/AZIN1穿透Matrigel Invasion Chamber的侵襲能力,結(jié)果顯示:A549-edt/AZIN1(477±68)穿過小室的細(xì)胞數(shù)量明顯多于A549-wt/AZIN1(327±42)(P<0.05),即A549-edt/AZIN1的侵襲能力比A549-wt/AZIN1的侵襲能力強(qiáng)。
9.通過Western blot檢測(cè)A549-edt/AZIN1和A549-wt/AZIN1中ODC的表達(dá)量
10、,發(fā)現(xiàn) A549-edt/AZIN1和 A549-wt/AZIN1中 ODC的蛋白表達(dá)量高于 A549(P<0.05),且ODC在A549-edt/AZIN1的表達(dá)量高于A549-wt/AZIN1,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P<0.05。
結(jié)論:
1.相對(duì)于癌旁正常組織,肺腺癌組織的RNA編輯水平升高。在肺腺癌腫瘤組織編輯水平最高的20個(gè)基因中,在基因編碼區(qū)的共涉及14個(gè)基因位點(diǎn),包括:COG3,SRP9,COPA,SRP
11、9,CACNA1D,RICTOR,ZNF669,METTL6, FLNA,AZIN1,C20orf30,PODXL,F(xiàn)LNB,PDZD7。
2.肺腺癌患者腫瘤組織中ADAR1與ODC的表達(dá)明顯高于癌旁正常組織,二者在肺腺癌中的表達(dá)呈正相關(guān)。肺腺癌患者腫瘤組織與癌旁正常組織中ADAR2的表達(dá)無明顯差異,主要為低表達(dá)。ADAR1蛋白的表達(dá)與肺腺癌患者的TNM分期和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況明顯相關(guān)。ODC蛋白的表達(dá)與肺腺癌患者的TNM分期明顯
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