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文檔簡介
1、目的:本研究旨在從環(huán)境適應(yīng)性角度探索 ATP2B1是否為原發(fā)性高血壓的易感基因。
方法:采用病例-對照研究,以年齡和性別為條件進行1:1匹配,共有1804名(原發(fā)性高血壓病例組和對照組均為902例)寧波市三代以上的漢族居民納入本次研究。通過問卷調(diào)查、體格檢查收集研究對象的人口信息學(xué)、既往病史、臨床指標(biāo)等信息;采用酚-氯仿法提取血液基因組中的DNA;運用Tm-shift基因分型技術(shù)進行基因分型;通過 CEPH-HGDP數(shù)據(jù)庫獲得
2、 ATP2B1基因原始數(shù)據(jù)。采用 logistic回歸、多因子降維分析(MDR)研究 SNPs與非遺傳環(huán)境因素的交互作用對原發(fā)性高血壓的影響;Pearson-相關(guān)分析和多元線性逐步回歸分析單一環(huán)境氣候因素或復(fù)合環(huán)境氣候因素與候選 SNPs的關(guān)聯(lián)性,最后采取基于群體理論的FST和連鎖不平衡理論的i H S兩種自然選擇分析方法進行分析,綜合 FST和iHS結(jié)果,篩選得到受環(huán)境正選擇的SNP。
結(jié)果:ATP2B1基因的7個 tagS
3、NP(rs17249754、rs2854371、rs3741895、rs2070759、rs11105357、rs957525和 rs11105358)基因型分布均符合 Hardy-Weinberg(H-W)遺傳平衡定律。在總?cè)巳汉团匀巳褐?ATP2B1基因 rs2070759和 rs17249754位點上的A等位基因(OR分別為1.15和1.27)、G等位基因(OR分別為0.82和0.80)與原發(fā)性高血壓之間存在關(guān)聯(lián)性(P值均0.0
4、5)。rs2070759、rs17249754、TC、TG和 BMI的聯(lián)合作用能夠增加原發(fā)性高血壓的易感性(OR=1.83,95%CI=1.01-3.30)。進一步分層分析顯示 rs2070759和rs17249754與原發(fā)性高血壓之間的關(guān)聯(lián)性僅現(xiàn)在 BMI25的人群中。本研究獲取了 ATP2B1基因在 CEPH-HGDP數(shù)據(jù)庫中共130個 SNP的數(shù)據(jù)進行分析。FST和 iHS分析顯示,ASN、CEU和 YRI三個人群間|iHS2的S
5、NP有10個,這10個 SNP中有3個 SNP(r s10506977、rs17192551、rs2681472)的FST大于0.25。Pearson相關(guān)性分析和多元線性逐步回歸分析提示,rs10506977和 rs17192551僅與緯度相關(guān),而 rs2681472與環(huán)境溫度相關(guān)。原發(fā)性高血壓易感基因 ATP2B1 rs2681472等位基因頻率與環(huán)境溫度存在正相關(guān)性(2=0.718)。
結(jié)論:中國漢族人群中 ATP2B1基
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