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文檔簡介
1、目的:
分析和對比功能性消化不良(functional dyspepsia,F(xiàn)D)患者與健康對照者(healthy control,HC)唾液中菌群的差異,探討FD不同亞型和焦慮狀態(tài)對唾液菌群組成的影響,篩選出與疾病狀態(tài)相關的特征性菌群。
方法:
收集68例FD患者及47例HC的唾液標本,每個入組者均填寫GAD-7(generalized anxiety disorder-7,GAD-7)焦慮量表,并計算得
2、分。依據羅馬Ⅲ標準和GAD-7量表分值,從中選出40例FD患者,包括餐后不適綜合征(postprandial distress syndrome,PDS)和上腹痛綜合征(epigastrie pain syndrome,EPS)各20例。伴焦慮狀態(tài)(anxiety-positive functional dyspepsia,F(xiàn)D.P)和不伴焦慮狀態(tài)(anxiety-negative functional dyspepsia,F(xiàn)D.N)各
3、20例。HC組20例。提取唾液中的總基因組DNA,采用Illumina高通量測序技術對樣本中所有細菌的16S rRNA-V4區(qū)進行DNA測序,并進行包括操作分類單位(operational taxonomic units,OTUs)、Alpha多樣性、Beta多樣性等生物信息學分析,并獲得各組之間的差異性細菌。所有入組者均無幽門螺桿菌(helicobacter pylori,Hp)感染。
結果:
FD組唾液中菌群在門
4、水平以變形菌門、擬桿菌門為主,屬水平以奈瑟菌屬、梭桿菌屬為主。EPS組和PDS組、FD.P組和FD.N組菌群結構在門及屬水平與FD組相似,即以變形菌門、擬桿菌門、奈瑟菌屬、梭桿菌屬為主。從Chao1、ACE、Shannon等alpha指數及稀釋曲線等分析,提示各分組的豐度及多樣性較合理。但FD組、EPS組、PDS組唾液菌群的Alpha指數與HC組相比沒有明顯差異。FD.P組菌群豐度較FD.N組和HC組明顯減少,多樣性則沒有明顯差異。采用
5、LEfSe(linear discriminant analysis effect size tool,LEfSe)分析篩選組間有顯著差異的菌群。FD與HC組之間有差異菌群共有13個,包括擬桿菌門、普式菌屬、韋榮氏球菌屬、γ變形菌、變形菌門、巴氏桿菌科等,其中5種在FD組富集。PDS組和EPS組兩組間特異性的菌群有γ變形菌、巴氏桿菌科、巴氏桿菌目,但僅在PDS組富集。PDS組和HC兩組間特異性的菌群有8種,包括變形菌、巴氏桿菌科、擬桿菌
6、門等,其中5種在PDS組富集。EPS和HC兩組間特異性的菌群有7種,包括韋榮氏球菌屬、韋榮氏球菌科、普氏菌屬等,僅在HC組富集。FD.N組與HC組有差異的菌群有12種,包括擬桿菌門、普氏菌屬、韋榮氏球菌科、巴氏桿菌科、β變形菌、變形菌門等,F(xiàn)D.N的優(yōu)勢菌群有5種。FD.P組與HC之間有差異的菌群共有4個,包括鏈球菌科和鏈球菌屬等。FD.P組與FD.N組之間未發(fā)現(xiàn)有差異性的菌群。
結論:
與HC相比,F(xiàn)D患者唾液菌群
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