外顯子連接序列與連接處內(nèi)含子序列的相互作用.pdf

1、分類號(hào)UD C論文題目學(xué)校代碼：1 0 1 2 6密級(jí) 編號(hào)——學(xué)院( 中心) ：學(xué) 號(hào)： 3 1Q 壘魚盟Q專2 0 1 3 年4 月 3 目外顯子連接序列與連接處內(nèi)含子序列的相互作用摘要內(nèi)含子作為一類非編碼R N A 與m R N A 一起轉(zhuǎn)錄。許多間接證據(jù)暗示，剪接后的內(nèi)含子和相應(yīng)m R N A 序列應(yīng)該存在相互作用。我們認(rèn)為這種相互作用體現(xiàn)在兩者之間存在的序列匹配區(qū)域上，它們?cè)诨虮磉_(dá)調(diào)控過程中起著非常重要的作用。基于這一思路，

2、采用S m i t h ．W a t e r m a n 局域比對(duì)方法得到外顯子連接序列與連接處內(nèi)含子序列的最佳匹配片段，研究了它們?cè)谕怙@子連接序列上的分布和最佳匹配片段的特征，并對(duì)其機(jī)制性的問題進(jìn)行了探討。主要研究?jī)?nèi)容如下：1 ．分析了2 7 個(gè)物種的核糖核蛋白基因內(nèi)含子與相應(yīng)外顯子連接序列之間的最佳匹配區(qū)域在外顯子連接序列上的分布。結(jié)論如下：1 ) 在匹配頻率分布中，一些低等真核生物外顯子連接處上游顯示出了E J C 結(jié)合的信息，高

3、等真核生物則沒有。序列分析顯示，所有物種的E J C 結(jié)合區(qū)域序列呈現(xiàn)出低的結(jié)構(gòu)序或相對(duì)于外顯子其它部分序列構(gòu)成更加隨機(jī)。表明E J C和內(nèi)含子這兩類調(diào)控元件在與外顯子序列結(jié)合的過程中存在相互競(jìng)爭(zhēng)和相互協(xié)作的關(guān)系。2 )最佳匹配片段的平均長(zhǎng)度約為2 0 b p 左右，配對(duì)率主要分布在6 5 ％～8 0 ％之間，少數(shù)片段的配對(duì)率達(dá)到1 0 0 ％。它們與s i R N A 并t l m i R N A 這兩類非編碼序列的結(jié)合特征是一樣的。

4、2 ．在全基因組水平上，分析了線蟲，擬南芥和黑腹果蠅蛋白質(zhì)編碼基因的內(nèi)含子與其相應(yīng)外顯子連接序列的最佳匹配頻率分布。結(jié)果發(fā)現(xiàn)：1 ) 在外顯子連接處出有明顯變化；第一內(nèi)含子和與其它內(nèi)含子的最佳匹配頻率分布是存在差異的；長(zhǎng)內(nèi)含子和短內(nèi)含子與相應(yīng)外顯子連接序列的結(jié)合強(qiáng)度是有差異的。表明第一內(nèi)含子和長(zhǎng)內(nèi)含子有重要的生物學(xué)功能，揭示了內(nèi)含子與其編碼序列是存在相互作用的。2 ) 最佳匹配長(zhǎng)度分布的最可幾長(zhǎng)度均在2 0 b p 左右，最佳匹配片段的