無針紐蟲線粒體基因組比較研究.pdf

1、基于線粒體基因組數(shù)據(jù)的系統(tǒng)發(fā)育分析已經(jīng)廣泛應(yīng)用在了許多動物類群上。已知紐形動物約1280個物種，而只有14個線粒體基因組儲存在GenBank中。本文新報道了9種無針類紐蟲線粒體基因組，并聯(lián)合數(shù)據(jù)庫中已有的數(shù)據(jù)重建了紐形動物門的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。
　　新測出的紐形動物線粒體基因組中，七個是異紐，分別是亨氏無溝紐蟲（Baseodiscus hemprichii，全長15205bp）、戈怪紐蟲（Gogonorhynchus sp.，全長15

2、334 bp）、美麗小尾紐蟲（Micrura bella，全長16847 bp）、血色喙紐蟲（Ramphogordius sanguineus，全長15322 bp）、環(huán)紋背睪紐蟲（Notospermusgeniculatus，全長15053 bp）、瀧氏離縱溝紐蟲(Paralineopsis cf.taki，全長為15134bp)和椒斑巖田紐蟲（Iwatanemertes piperata，全長16382 bp）。異紐類紐蟲的線粒體基

3、因組組成一致，編碼37個基因（包括13個蛋白質(zhì)編碼基因、兩個核糖體RNA基因和22個轉(zhuǎn)運RNA基因）。六個紐蟲的線粒體基因組與之前發(fā)表的異紐類紐蟲有著相同的基因順序，而戈怪紐蟲線粒體基因組的兩個亮氨酸轉(zhuǎn)運RNA的位置發(fā)生了互換。
　　古紐的井島小休氏紐蟲（Hubrechtella ijimai）與斑管棲紐蟲（Tubulanuspunctutus）的線粒體基因組長度分別為15224bp和15307bp，它們的基因排列順序與其他紐蟲較

4、大差異。井島小休氏紐蟲的線粒體基因組編碼了38個基因，比大多數(shù)紐蟲多了一個賴氨酸轉(zhuǎn)運RNA基因。
　　現(xiàn)有數(shù)據(jù)得出的紐形動物線粒體基因組平均長度為15354 bp，針紐類的平均長度最短(14793bp)，古紐類的平均長度最長(15657bp)，異紐類的長度居中(15567bp)。三大類群中異紐類的線粒體基因組AT含量最低(55.68％-66.03％)，其次為針紐類(67.44％-71.17％)，最高為古紐類(63.04％-75.7

5、8％)。對紐形動物線粒體基因組的基因排列順序研究后發(fā)現(xiàn)異紐類與其他類群享有更多的基因塊。13個蛋白質(zhì)編碼基因均顯示出了純化選擇效應(yīng)（Ka/Ks＜1），cox1基因表現(xiàn)出最強的純化選擇，atp8基因則顯示出最弱的純化選擇。大部分tRNA基因都能形成典型的三葉草結(jié)構(gòu)，一些絲氨酸t(yī)RNA缺失了DHU臂。古紐類和針紐類的trnS(AGN)基因反密碼子是GCT，在異紐類中通常是TCT，但本文新發(fā)表的異紐類紐蟲亨氏無溝紐蟲為GCT。
　　基于